शरद कळसकर याची न्यायवैद्यकीय चाचणी घेण्यात आली, तेव्हा 'मी आणि साथीदार सचिन अंदुरेने डॉ. दाभोलकर यांच्यावर गोळीबार केला,' अशी माहिती कळसकरने सीबीआयला दिली. याबाबत सीबीआयने विशेष न्यायालयात अहवाल सादर केले.
पुण्यातील विशेष कोर्टात सीबीआयने एक अहवाल सादर केला. या अहवालात कळसकर आणि अंदुरे या दोघांनी दाभोलकरांवर गोळ्या झाडल्याचे म्हटले आहे. डॉ. दाभोलकर हत्या प्रकरणात कळसकरचे वकील अॅड. संजीव पुनाळेकर आणि विक्रम भावे यांना 25 मे रोजी सीबीआयने अटक केली होती. 'गेल्या वर्षी जून महिन्यात मी अॅड. पुनाळेकर यांची भेट घेतली होती. त्या वेळी अॅड. पुनाळेकर यांनी डॉ. दाभोलकर यांची हत्या करण्यासाठी वापरण्यात आलेले शस्त्र नष्ट करण्याचा सल्ला दिला होता,' असे कळसकरने न्यायवैद्यकीय चाचणीत 'सीबीआय'ला सांगितले.